在進行煙囪防腐前首先要搞清楚的是煙囪使用的現有損傷情況和實際承載力狀態，對煙囪目前的安全性、可靠性、耐久性進行全面的評估。最終制定出科學的防腐施工方案及防腐材料的選擇。
煙囪防腐存在問題的嚴重性主要表現在三個方面：
1、涉及面廣
目前我國脫硫煙囪所采用的防腐方案中很多方案由于防腐材料本身的質量、施工質量等原因造成煙囪防腐出現過不同程度的損壞現象。
2、比例高
出現開裂、沖刷或脫落、酸液滲漏等問題較嚴重的有：國產泡沫玻璃磚、玻璃鱗片、0M涂料以及耐酸膠泥砲筑耐酸磚內筒等。
3、時間短
根據相關規范的規定，煙囪結構應滿足設計基準期50年要求，排煙功能設計應滿足工藝系統設計壽命30年的要求。但有的工程僅投運2個月即發現由于泡沫玻璃磚脫落對鋼內筒造成嚴重腐蝕；有的脫硫改造單筒煙囪工程項目投運后僅4個月即發生酸液沿煙囪外筒壁滲漏，造成對鋼筋混凝土筒身腐蝕。
煙囪防腐工程現有問題的主要原因
1、施工質量沒有滿足相關設計、施工和驗收規范，特別是對于粘貼防腐塊材類的，由于粘貼量大，且高空作業，加之監理旁站等措施不到位，這是導致脫硫煙囪防腐出現問題的主要原因。
2、部分防腐材料本身的質量不能滿足脫硫后煙氣環境的要求，目前我國應用于脫硫煙囪防腐的產品種類繁多，防腐產品的研發、應用及其成果的評審與鑒定等組織機構寬泛，難免魚目混珠，以致使防腐產品質量存在問題。
3、發電企業對脫硫煙囪防腐的認識和重視程度不夠，沒有將脫硫煙囪防腐納人到脫硫設備管理的范疇，低價中標及不合理的工期要求十分普遍，且疏于巡檢，導致部分脫硫煙囪防腐一旦發現問題即對機組運行帶來影響，甚至危及煙囪結構安全。